在慢性乙肝的综合治疗中，一般认为抗病毒治疗是关键，因为乙肝病毒不仅是乙肝发病的启动因子，也是病变持续发展的主要原因。因此，乙肝病毒在慢性乙肝的发病和发展过程中起主要作用。抗乙肝病毒治疗已成为慢性乙肝能否治愈的关键。长期抗病毒治疗是慢性乙肝患者所必需的。慢性乙肝患者需要长期进行抗病毒治疗，主要与乙肝的疾病学特征有关。归纳起来主要有以下几点：
第一，目前面世的乙肝抗病毒药物只能抑制乙肝病毒复制，而不能彻底消除乙肝病毒，一旦停止抗乙肝病毒治疗，乙肝病毒可重新复制，这是慢性乙肝复发的主要原因。只有长期进行抗乙肝病毒治疗，才有可能清除乙肝病毒。
第二，乙肝病毒为泛嗜性病毒，除在肝脏组织内复制外，还能在淋巴细胞、胆管上皮细胞和胰腺细胞等多种细胞组织中复制，而抗乙肝病毒药物不易进入细胞内，细胞内药物浓度较低，不易清除乙肝病毒或清除较慢。病人过早停药可以引起复发，因此适当延长疗程，以利于清除组织细胞内的乙肝病毒，提高疗效。
第三，乙肝病毒为高变异病毒，在复制过程中容易发生变异，乙肝病毒发生变异后可以造成免疫逃逸，更不易被机体清除。
第四，人体被乙肝病毒感染后，常使病人对乙肝病毒产生免疫耐受或免疫功能低下，使抗乙肝病毒药物的疗效明显降低，惟有通过长期的抗乙肝病毒治疗，才有可能达到基本治愈的目的。
