虽然干扰素治疗
乙肝有其独特的优势，但并不是所有人都适合干扰素治疗，也不是所有人进行干扰素治疗的效果都相同。因此，选择合适的治疗时机就非常重要。免疫清除期是干扰素抗病毒治疗的最佳时机，而且也可以取得最好的治疗效果。ALT在某种程度上可以反映机体免疫系统与
乙肝病毒之间斗争状况，在转氨酶升高时往往表示机体免疫系统正在清除病毒，或者说处于
乙肝病毒清除期。因此，通常临床上主要通过观察ALT水平的变化决定何时进行干扰素抗病毒治疗更为合适。一般而言，ALT越高，干扰素抗病毒的效果越高。一般的规律是：如ALT＞正常值上限的5倍，HBeAg血清学转换率可以达到50％以上；ALT在正常值的2～5倍，e抗原血清学转换率可以达到38％；ALT＜正常值的2倍，e抗原血清学转换率也可达到31％。
