超声引导下肝穿刺活检是确诊脂肪肝，特别是局灶性脂肪肝的主要方法，在对取出的肝组织作形态学检查时进行必要的特殊染色、组织生化检测及特殊细胞学检查等，可提高诊断的目的性。
国外曾报道2例CT和超声检查提示转移性肝癌的局灶性脂肪肝，肝活检证明为局部脂肪浸润。脂肪肝可见肝细胞内充满脂滴，胞核偏边，只有妊娠期和四环素脂肪肝的肝细胞内脂滴微小，均匀散布而胞核位于中央。多数疾病的脂肪浸润分布于小叶中央区，也有位于小叶周边区者。有的还伴有肝细胞坏死，淤胆或纤维化。
肝活检有创伤性，患者有时难以接受，故目前主要用于：①局灶性脂肪肝与肿瘤区别；②为探明某些少见疾病，如胆固醇酯储积病、糖原储积等病；③无症状性可疑非酒精性脂肪肝（NASH），肝活检是惟一诊断手段；④戒酒后酒精性肝病（ALD）或酒精性肝病有不能解释的临床或生化异常表现者；⑤肥胖减少原有体重10％后肝酶学异常仍持续者，须肝活检寻找其他原因；⑥任何怀疑不是单纯肝细胞脂变或疑有多病因引起者。
