慢性乙型肝炎患者，符合使用抗病毒治疗指证者，有效的抗病毒药物为干扰素和核苷类药物，选择何种药物好，应从药物性能、疗效、安全性、耐药情况、用药方法及治疗费用、个人承受能力等全面考虑。
干扰素的优点是通过诱导宿主产生细胞因子，在多个环节抑制病毒复制，血清学转换率高，缺点是适应证比较窄，副作用大，需要注射给药，且有一定禁忌证。目前，多数认为聚乙二醇干扰素抗病毒效果优于普通干扰素，药效持续时间长，但价格较昂贵。
核苷类似物的优点是口服方便，安全有效，HBV DNA下降快，但缺点是血清学转换率低，需要长期用药，可能产生耐药性，停药后易复发。
