由于纤维组织的增生，假小叶的生成，使得肝脏结构发生严重紊乱，从而诱发门脉高压。典型的门脉高压形成后，由于血管的重新开放，血流动力学的紊乱，伴随肝脏解毒功能的减弱和合成功能的下降，肝硬化患者的几个严重并发症就会接踵而来。
１上消化道出血与黑便：由于门脉高压导致侧支循环出现，引发食道、胃底静脉曲张和痔静脉曲张。由于曲张的血管壁很薄，尤其食道、胃底静脉更为突出，极易被颗粒状和有“棱角”的食物刮破，从而诱发上消化道出血。轻者表现为一过性黑便，典型者为柏油样便，重者则出现呕血与便血，颜色为咖啡色，严重者可出现大呕血，出血量达数百至数千毫升不等，预后凶险。
２肝性脑病：又称为肝昏迷。由于肝硬化后，肝脏解毒功能降低，机体代谢所产生的有毒物质如氨类、硫醇、芳香族氨基酸等不能被肝脏有效解毒。上述有毒物质随新开放的血管绕开肝脏直接进入脑组织，造成中枢神经系统严重受损。患者因中毒程度的不同，而表现为精神委靡或精神错乱、嗜睡、昏睡、谵妄、狂躁等，严重者进入昏迷状态，对外界刺激无任何反应。部分患者则死于肝性脑病。
３肝肾综合征：肝脏病的晚期，出现进行性的肾衰竭。患者表现为少尿、无尿和严重的酸碱平衡失调和电解质紊乱。多数患者最终死于肾衰竭。
４腹水：由门脉高压、低蛋白血症等综合因素所致。患者表现为腹胀、腹部膨隆，典型者呈“蛙状”腹。腹水量可自数百至数千毫升不等。久治不消的腹水者称顽固性腹水，患者可合并脐疝，并极易诱发自发性腹膜炎。同时也是诱发患者出现腹胀、食欲不振、纳差等消化道症状和肝肾综合征的重要因素。
５原发性肝癌：如前所述，一旦出现，将严重影响患者的生活质量并危及患者的生命。上述并发症一旦出现，标志肝硬化已进入失代偿期。近５０％～６０％的失代偿肝硬化患者在５年之内死于以上并发症。
