脂肪肝患者肝细胞脂肪变性或坏死，使肝脏的兔疫功能下降，脂肪肝患者常伴有肝脾肿大。脾脏也是人体重要的免疫器官，脾大会造成脾功能亢进，脾功能异常便会抑制细胞免疫的功能，所以脂肪肝患者由于免疫功能降低，抵抗力差，更容易被感染。另外，肝细胞脂肪变性后，解毒功能降低，容易造成内毒素、外毒素在体内的潴留，对机体造成毒害。
总之，胃、肠、肝、胆都是消化系统的重要器官，机体摄取三人营养索(蛋白、脂肪、糖类)都要经过肝脏的代谢才能被机体所利用。脂肪肝患者肝脏功能受损，时间一长就会累及脾、胆、胃、肠。肝脏有病常影响胆囊的功能，脂肪肝患者中有20%~30%伴有慢性胆囊炎、胆结石症，因此，脂肪肝的早期防治显得尤为重要。
