乙肝与肝硬化的关系十分密切，慢性
乙肝是形成
肝硬化的基础之一，肝炎后
肝硬化患者大多来源于显性或隐性的慢性乙肝患者。现有的肝硬化患者中可以检测出乙肝病毒感染指标者可达70％～90％，其中约80％乙肝病毒表面抗原(俗称“澳抗”)为阳性，约30％乙肝病毒e抗原为阳性(俗称“
大三阳”)，表示这些肝硬化患者是在
乙肝病毒持续存在、复制，病变的长期活动中发展而来。还有许多肝硬化患者
乙肝病毒核心抗体呈阳性，以及一些不明原因的肝硬化患者，进行肝穿刺组织学检查，发现肝组织内部仍然存在乙肝病毒，乙肝与肝硬化的密切关系已被大量的流行病学和临床调查所证实。乙肝病毒持续感染，加上患者的免疫缺陷，肝组织长期处于炎症状态，炎症坏死激发肝组织再生修复机制，再生过程中不能完全恢复到原先的正常状态，修复伴随着纤维结缔组织增生(瘢痕组织)，纤维组织逐渐侵占肝脏小叶，使其结构改变，最终导致肝硬化。早期肝组织纤维化，经过治疗和调养，尚可以逆转，已形成肝硬化后则难以恢复。
慢性乙肝如果表现为持续轻度、迁延多年，病情较轻，可能最终发展为亚腺泡小结节型肝硬化；如果病情严重、肝组织(多腺泡)短期出现大片坏死，肝硬化的进程就会加速，大量纤维化和再生，最终发展为大结节型肝硬化；
慢性乙肝原已形成小结节型肝硬化，一旦炎症活动加剧，可发生融合性坏死，则在小结节基础上发展为大结节型肝硬化，导致混合结节型肝硬化形成。
