检测是何种病毒引起的肝炎需要依靠血清学和病原学方法。血清学检查主要用已知抗原查病人体内的杭体，或用已知杭体查杭原。检查方法很多，目前常用的有酶联免疫吸附法(ELISA )，以自动分析仪检查，也有采用放射免疫法，不同仅器及不同的方法敏感性和检出率稍有差异，即有一定的假阳性或假阴性，所以有的病人在不同医院的检查结果可能不完全一致。
病原检测常用最先进的分子杂交技术，如多聚酶链反应(PCR)是DNA扩增技术，可在2~3小时内将标本中极微量的核苷酸片段扩增许多万倍，故检测血清中病毒核酸(DNA或RNA)的灵敏度和特异性均极高，为最可靠、最精确的诊断方法。
