目前，国内外公认的抗HBv治疗药物为:干扰素(普通干扰素和聚乙二醇干扰素)、拉米夫定、阿德福韦、恩替卡韦和替比夫定。许多病人经常询问:如何选用这些抗病毒药物?这个问题最好由医生根据不同药物的适应证、用法、疗程及使用时机等，具体选用。鉴于病人应该了解自己的病情和用药，现将各药的基本特点作一简要比较。
(1)普通干扰素:品种多、临床使用早，必须通过皮下注射，每周3次或隔日注射1次用药，疗程一般需6个月，也可延长至1年。HBeAg阴转和转换率较高，其中极少数可出现HBsAg阴转或转换，但副作用较大，对垂直传播者效果不佳，肝硬化晚期、高度黄疸者不能使用干扰素。
(2)聚乙二醇干扰素:克服了普通干扰素治疗的局限性，只须每周注射一针的给药方法，就能持续保持干扰素在体内的生物活性，治疗48周停药后仍能维持稳定的免疫应答效应，HBeAg阴转和转换率明显高于普通干扰素，惟价格较昂贵。
(3)拉米夫定:抑制病毒作用强，可用于肝功能失代偿者，耐受性好，副反应少，每日口服1次，用药方便，但疗程较长，必须1年以上(实际应用多超过2年)，累计费用亦不少，且随着用药时间延长，产生YMDD变异者增多，疗效不够持久，甚至在停药后可能出现病情恶化。
(4) 阿德福韦酯:是核苷酸类似物之一，与拉米夫定相比，耐药发生率低，对拉米夫定耐药株亦有效，但其抗HBV的强度不如拉米夫定，可用于拉米夫定治疗后发生病毒变异者，是与其他核苷类似物联合治疗的良好选择。单独治疗时也适合用于ALT偏高、HBV DNA偏低和体重偏低的患者。
(5)恩替卡韦:为2005年被批准用于乙型肝炎治疗的核苷类似物，性质与阿德福韦类似，但抗病毒活性更强，对初治者耐药率低，对HBV治疗又多了一种选择，惟在临床应用时间尚短，药价仍较高。
(6)替比夫定:具有迅速抑制HBV DNA的作用，同时HBeAg阴转/转换率高于其他核苷类，惟耐药率略高。2006年在我国被批准用于临床治疗的核苷类药物，其作用与疗效等尚待深入研究。
以上药物虽为公认较肯定的抗病毒药，各有利弊，临床医生应根据病情结合各方面情况，确定选药及治疗方案。
