目前医学界的共识是，不是所有慢性乙肝患者都需要抗病毒治疗，但只要有抗病毒适应证，就应积极进行抗病毒治疗。此举不仅可以把握最佳治疗时机，提高治疗效果和改善生活质量，也将是最为经济的做法。之所以这么说，是因为中国符合抗病毒治疗适应证的乙肝患者中采取抗病毒治疗的人只占20％左右。大部分患者采用对症的“保肝”治疗，症状暂时控制了，但病毒的复制水平并未得到有效控制，容易导致病情反复，因此不仅增加了复诊费用，反而耽误了治疗最佳时机，并且使得肝硬化等并发症的发生率也明显增加。保肝药的费用加上可能的并发症治疗费用，实际上患者总体治疗费用并不低。这恐怕是当初只考虑费用而选择保肝治疗的患者所没有想到的。
目前抗病毒治疗药物分两大类：干扰素类和核苷（酸）类似物。抗病毒治疗的用药疗程，首先要看患者e抗原的情况。e抗原阳性者疗程较明确，e抗原阴性者疗程不确切，治疗的疗程长于阳性者。
在治疗中，由于对治疗效果的错误判断和对疗程、停药指征的认识不足以及经济和不良反应等方面的因素，乙肝患者常擅自停药，可导致病情发展和反复，就达不到抗病毒治疗的目的。最好能在初始治疗时，选中符合个人情况的药物，并坚持治疗下去，以达到最佳的治疗效果。
