干扰素是目前临床上治疗乙肝的主要药物之一，但是只有选择合适的适应证，方可奏效，有相当一部分患者不属于治疗适应证，万不可硬性使用干扰素，否则贻害无穷。以下列举干扰素治疗乙肝的慎用或禁用指征，供患者参考。
（1）急性乙肝病人。急性乙肝多为自限性疾病，适当休息，加强对症治疗（保肝护肝，降酶降黄）和支持疗法（葡萄糖、维生素等）就能治愈，不需要抗病毒治疗。如果急性乙肝病程超过半年，乙肝病毒复制指标仍呈阳性（ＨＢｅＡｇ、ＨＢＶＤＮＡ等），表明病情有可能转为慢性，此时可以考虑使用干扰素或其他抗病毒药物。
（2）乙肝患者处于免疫应答过强期。患者转氨酶水平超过正常值10倍，自身处于免疫清除病毒阶段，自身免疫清除过程，造成被感染肝细胞的损伤，此时使用干扰素，可能会加大肝细胞损害程度。
（3）肝功能损害严重，肝组织储备功能极差者，如肝硬化失代偿期、重度或重型肝炎，血清胆红素明显升高、白蛋白降低，白／球比值小于1.0者，如果应用干扰素，有可能会加重病情，导致肝功能衰竭，病情恶化。
（4）有脾功能亢进，血小板、白细胞明显下降者。
（5）有自身免疫性疾病者（甲状腺炎、类风湿关节炎、溃疡性结肠炎等），尤其是有自身免疫性肝炎者应属于禁忌之列，否则会加重上述原发病。
（6）伴有其他主要脏器，如心脏、肾脏严重疾患者。精神异常者也禁忌使用干扰素。
（7）有明确乙肝家族史，属于母婴或父婴垂直传播者。这类患者自幼感染乙肝病毒，机体免疫处于麻痹或耐受状态，使用干扰素治疗，应答率极低。
