很多乙肝患者在经过正规的治疗后，可使病毒复制指标转阴。然而在这个时候一定不要随意停药，要慎重地判断病毒指标转阴的实质，从而得出一个正确的治疗方案。
有些患者通过各种治疗方法，不但乙肝病毒指标转阴，而且e抗体和核心抗体也呈现阴性。这种情况多见于急性乙肝恢复后或是慢性乙肝病毒携带者自愈，这时患者的症状和体征都比较平稳，肝功能也保持良好的状态。如果是急性乙肝患者，可选择一两种药物进行维持治疗，时间为1-2个月。如果是慢性乙肝，则应该继续应用抗病毒药和免疫调控药。如果直接停药，很可能导致前功尽弃，所以医生要根据患者的病情和各项检查结果，慢慢调整用药的剂量和时间。
有些肝炎患者虽然病毒指标转阴，但是症状却越来越重，这是因为病毒转阴的实质是由于病毒变异，而不是机体好转造成的，所以医生就要加强治疗。如果这时候医生受到病毒指标转阴的影响而放弃治疗，就会使病毒更严重地破坏肝细胞，极有可能导致肝硬化。
对乙肝治疗来说，目前尚无特效的药物，那些病毒指标转阴的患者仍要坚持保肝、提高免疫力、抗纤维化等方面的治疗，以促进肝脏的康复。
