从现有的乙型肝炎病毒检测指标看，需要转阴的乙型肝炎病毒指标是乙型肝炎系统中的3项抗原，即乙型肝炎病毒表面抗原（HBsAg）、乙型肝炎病毒e抗原（HBeAg）、乙型肝炎病毒核心抗原（HBcAg），以及乙型肝炎病毒脱氧核糖核酸（HBV-DNA）。如果这些乙型肝炎病毒标记物统统消失，则可以认为乙型肝炎获得彻底治愈。由于外周血液中没有游离的乙型肝炎病毒核心抗原，所以抽血检查尚无法了解到乙型肝炎病毒核心抗原的情况，这本身给正确判断乙型肝炎病毒转阴治疗带来了不少麻烦和困难。现在依靠乙型肝炎病毒核心抗体的检测来侧面推断乙型肝炎病毒核心抗原的情况，如果化验结果为乙型肝炎病毒表面抗原、乙型肝炎病毒e抗原、乙型肝炎病毒核心抗体同时阳性，一般此时乙型肝炎病毒脱氧核糖核酸也会呈阳性，表示病毒处于复制状态，传染性强，是进行抗病毒治疗（转阴治疗）的时机。如果经过治疗，乙型肝炎病毒e抗原、乙型肝炎病毒脱氧核糖核酸获得阴转，则可认为抗病毒治疗疗效显著；如果其中一项阴转，说明有效，仍要继续抗病毒治疗，直到两项病毒复制指标都阴转为止。如果病人检查结果为乙型肝炎病毒表面抗原、乙型肝炎病毒e抗体（抗-HBe）、乙型肝炎病毒核心抗体（抗-HBc）为阳性，乙型肝炎病毒脱氧核糖核酸为阳性，依然认为病毒处于复制状态，有传染性，也需进行抗病毒治疗，直到乙型肝炎病毒脱氧核糖核酸阴转为止。如果乙型肝炎病毒指标仅为表面抗原阳性，乙型肝炎病毒e抗原及乙型肝炎病毒脱氧核糖核酸为阴性，则不属于抗病毒治疗（转阴治疗）的范畴。总而言之，目前乙型肝炎病毒的转阴治疗只是针对乙型肝炎病毒e抗原、乙型肝炎病毒脱氧核糖核酸这两项指标而言。对于乙型肝炎病表面抗原（澳抗）尚无任何有效药物治疗。
目前各种抗病毒药物只能抑制乙型肝炎病毒复制、缓解肝脏的炎症活动，对于整合的乙型肝炎病毒无作用，对于肝细胞核内乙型肝炎病毒的超螺旋共价闭合环脱氧核糖核酸（CCCDNA）也无作用，故停药后CCCDNA又重新成为病毒复制转录的模板，乙型肝炎病毒脱氧核糖核酸可能再次恢复到用药前的水平。抗病毒药物联合免疫调节治疗可以减轻不良反应，增强抗病毒效果，但总体疗效仍未有根本性改善。新的抗病毒治疗方法，如基因疗法、疫苗疗法、导向疗法仍处于实验研究阶段，尚未获得认可。因此，目前尚不存在能使乙型肝炎病毒永久阴转的药物和疗法。
