隐匿性乙肝病毒感染为HBsAg阴性的乙肝病毒感染，常称为隐匿性或沉默性、潜在性乙肝病毒感染，通常会出现抗HBc等血清乙肝病毒标志阳性，甚至出现抗HBs，也有20％的患者血清乙肝标志物均为阴性。肝功能异常或肝组织有炎症反应，一旦血清HBV DNA阳性或实时PCR法HBV DNA阳性或肝穿刺肝组织中找到HBsAg和（或）HBcAg，应诊断为隐匿性乙肝。
通过敏感的检测方法，可在患者血清、淋巴细胞和（或）肝组织中检测到HBV DNA，目前实时PCR为最敏感的检测方法，隐匿性肝炎病毒复制一般在100～1000拷贝/毫升，而实时PCR可检测到50拷贝/毫升（目前这种检测方法北京和上海等地可做）。经肝穿刺检查，在肝组织中不但能找到HBsAg和（或）HBcAg，还有可能发现不同程度的炎症或纤维化。
