乙型肝炎的抗病毒治疗应该采用安全、有效的长期用药方案。有条件可联合用药。
1．安全抗乙肝病毒药物的安全原则是：药物对肝脏不能造成二次伤害；其代谢产物经过肝、肾排泄后要能够较快排出体外，以免产生蓄积中毒；对人体其他系统的影响较少。
2．有效抗病毒药物对HBV-DNA要有明显的抑制作用；对HBeAg血清转换有明显的作用；若能作用与病毒的cccDNA则更佳。
3．长期研究人员在动物实验中发现，多数核苷类抗病毒药物在显著降低血清HBV-DNA的同时，肝内HBV-DNA也有不同程度下降。只有随着时间推移，肝细胞不断更新，肝内cccDNA才有可能逐步清除。但由于肝细胞寿命较长，加上肝细胞在再生过程中有HBV再感染的可能性，所以疗程较长，例如拉米夫定就要求至少使用1～2年以上，曾有文献报道有服用拉米夫定8年以上的病例。因此，采用核苷类抗病毒药物若疗程不足，病情和病毒都可以反跳，所以在目前几乎所有的药物难以作用于cccDNA的情况下，延长疗程仍是一个无奈和重要的选择。
4．联合用药在使用抗病毒药物时，大量的病毒一边被清除一边又产生，而且新病毒在复制过程中会产生很多可以逃避药物治疗的变异株，如果只用一种药物来治疗，乙肝病毒只要做小小的变异就可以存活，甚至还产生耐药性，使药物很快丧失效用。如果根据病情，将几种药物联合使用。不同药物针对病毒繁殖周期中的不同环节，最大限度地抑制病毒的复制；或在抗病毒的同时，恢复被破坏的机体免疫功能，从而达到最后彻底清除体内病毒、治愈疾病的目的。前述第2章第5节的“鸡尾酒疗法”就属于联合用药的范例。联合用药的基本原则应为：
（1）最大限度地抑制病毒复制，减少基因突变机会；
（2）提高机体抗病毒特异性免疫；
（3）加强肝脏各种细胞，包括肝实质细胞的抗病毒能力，争取彻底清除体内残留乙肝病毒，防止复发，达到根本治愈的目的。
