衡量乙肝是否传染和传染力大小的最重要指标是HBV-DNA和e抗原，无论什么情况下，只要这两项指标呈阳性，就可认为，具有传染性。只要这两项指标定量检测处于高水平，就说明处于传染力最大的时期。
1．HBV-DNA
HBV-DNA是乙肝病毒基因，与乙肝的发展、治疗、预后和转归关系密切，是乙肝病毒复制和传染性的最直接的指标。在乙肝活动期，HBV-DNA呈现阳性，含量越高，传染力越大。HBV-DNA的定量检测目前以拷贝/毫升（copy/ml）表示，一般认为，低于105copy/ml为传染力弱，105～106，为传染力一般，大于107为传染力很强。
2．e抗原（HBeAg）
e抗原（HBeAg）属于乙肝病毒核壳蛋白，是除HBV-DNA以外判断乙型肝炎病毒复制的一个有效指标。血清中HBeAg消失表明预后良好，若HBeAg持续阳性提示乙肝病毒在体内持续复制，肝病易反复活动预后差。但要注意，对部分患者来说，HBeAg的阴性并不意味着病毒的清除或复制水平的降低和消失，有的HBeAg阴性患者，HBV-DNA仍可阳性，这就是我们常说的HBeAg阴性肝炎，这种情况，除了HBV-DNA阳性外，肝功能也会出现异常。
HBeAg过去一般只进行定性检测，现在有的单位已经开展定量检测，以滴度或PEIU/ml（PaulEhrlichInstituteUnit）表示e抗原的高低。有人[王日春，等，浙江预防医学2006，18（6）：79]对HBV-DNA、HBsAg、HBeAg三者之间的关系进行了定量分析，发现HBsAg的滴度与HBV-DNA拷贝数无明显相关，而e抗原的滴度与乙肝病毒基因拷贝数明显相关，说明表面抗原的滴度高低不能反应病毒的复制程度，HBeAg的滴度和HBV-DNA拷贝数的高低则可以用来判断病毒的复制情况以及评价药物的疗效。
