疾病的过程，从邪正的关系来说，是正气与邪气矛盾双方互相斗争的过程。邪正斗争的胜负，决定着疾病的进退。邪胜于正则病进，正胜于邪则病退。因而治疗疾病，就要扶助正气，祛除邪气，改变邪正双方的力量对比，使之向痊愈的方向转化。正确处理扶正与祛邪的关系，恰当运用扶正、祛邪，是治疗乙型肝炎应当遵循的又一原则。
急性乙型肝炎在初期一派邪实的表现，如恶寒发热、黄疸、腹胀、胁痛、恶心呕吐等，以邪实为主，此时应以祛邪为先。但“正气存内，邪不可干”，“邪之所凑，其气必虚”，既然有病毒侵袭人体，必然有正气不足，只不过此时以邪实为主要矛盾罢了。随着病情的发展，急性乙型肝炎到了恢复期，邪气渐退，正虚逐渐显露，此时治疗应扶正与祛邪并重，或扶正为主，兼以祛除余邪，使邪去正复，则病自康复。重型乙型肝炎初期邪气极盛，进一步发展邪气不但不退，正气亦渐显不足，到后期可形成正虚气血欲脱，邪气留恋不去之势。所以，重型乙型肝炎的治疗，早期宜急以祛邪，以顿挫病势，维护正气，防患于未然。随着病情的进展，可采取扶正与祛邪同施，或在扶助正气、维护生命的基础上，针对不同病情进行治疗。否则，不注意扶助正气，不但病邪难去，生命也难以维持。
慢性乙型肝炎多由急性演变而来，湿热余邪仍然存在，但因肝郁气滞，气滞而血瘀，故瘀血亦较为突出，患者常有胁肋刺痛、肝脾大、腹胀便溏、舌紫暗有瘀斑、脉沉弦等症状，这是其实的一面。“久病必虚”，由于病程较长，精血内夺，可导致肝肾阴虚；肝郁脾虚，化源不足，则肝脾两虚；如若湿困脾阳，还可引起脾阳不振甚至脾肾阳虚。这是其虚的一面。不要认为慢性乙型肝炎一定就是虚证，而忽视其实的一面，慢性乙型肝炎常是湿热之邪未尽而正气内损，多呈正虚邪恋、虚中夹实、本虚标实之候。在治疗上，单纯使用扶正或祛邪均难契合病机，祛邪不能忽视扶正，扶正不能忘记祛邪，同时要分辨主次。对以湿热为主者，清热利湿才有利于病体康复。
