接种乙肝疫苗是预防乙型肝炎最主要和最有效的方法，通过接种疫苗后产生保护性抗体(抗-HBs)，即可预防HBV感染，抗体多在接种疫苗后逐步缓慢产生，一般接种疫苗1针后抗-HBS阳转率在20%以下，接种第2针后的阳转率在40%~60%左右，3针全程免疫接种后(约半年左右)，抗-HBs阳性可达到90%以上，故强调一定要全程接种3针。抗-HBS阳性在体内出现后，一般可保持5~10年，以后随着时间延长，抗体水平逐年下降，以至消失。欲了解注射后血中抗体是否仍然存在，应定期复查，如若抗体消失，可根据情况在医生指导下再注射乙肝疫苗加强针1针，即可恢复抗体水平。
新生儿注射乙肝疫苗的保护率出现较早，一般强调应尽早接种，以及早产生保护作用，第一针接种必须在出生后24小时内。有人报道1周内单独接种乙肝疫苗的保护率为70%~95%，而1周后接种的保护率仅为50%~57%。
接种疫苗后的效果要视不同情况具体分析，有少数人(约5%~10%)即使全程按计划接种也始终不产生抗体，或只产生低滴度抗体，这可能与疫苗及个体反应性有关，对这些人群可进行复种。当然，要根据检测血清抗-HBs水平，在医生指导下进行。
