实验室检查有一般检查，血常规(包括红细胞、白细胞、血红蛋白、血小板)和尿、粪常规检查一般均在正常范围。肝功能检查，早期即有明显改变，为肝脏损害的重要依据，但不能确定是哪一种肝炎。要确诊甲型肝炎主要是查甲型肝炎特异性杭体。
甲型病毒性肝炎只有一种病毒标志物，即HAV抗原及抗体系统。临床诊断甲型肝炎时，发现病毒标志是最可靠的方法。检查甲型肝炎病毒(HAV)的标志通常采用酶联免疫吸附法(ELISA)检测甲肝杭体(抗-HAV)，阳性可明确诊断。其中IgM型抗体(抗-HAv IgM)阳性更具有早期诊断意义，此法操作简单、经济实用，为临床上的常用检测方法。只要有肝炎的症状、体征和肝功能改变，加上抗-HAV阳性，即可完全确诊。
检测甲肝病毒杭原或用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)检测肝炎病毒核酸(HAV RNA)，虽然灵敏度很高，但检测步骤复杂，要求条件高，难以在一般实验室常规应用。至于病毒培养、分离，要求更高，仅在进行科研时应用。
