1、肝炎后脂肪肝：肝脏中的脂肪含量明显增加，超过肝脏重量的5%，甚至40%以上。在肝细胞内充满了脂肪，易发生脂肪变性，其中主要是甘油三酯发生变性。引起脂肪肝的原因很多，其中病毒性肝炎合并脂肪肝者约占49.4%。
2、糖尿病:肝脏是糖代谢的重要场所。当肝脏发生病变时，可使糖代谢发生障碍。患病毒性肝炎时可引起糖代谢紊乱。据统计，肝炎并发糖尿病的发生率在5%~10%，肝硬化患者糖尿病的发生率可高达37.5%~50%。
3、胰腺炎:其发生率在5%左右，肝炎是一种全身性疾病，除了肝脏本身有病以外，其他内脏组织器官都可受到不同程度的影响，因此有些人患肝炎后同时发生胰腺损害。并发胰腺炎的原因可能是病毒感染致胰腺炎症，同时也可能存在免疫机制损害。
4、胆道感染:肝炎患者并发胆道感染较常见，可能是由于肝炎病毒本身侵犯胆道系统而引起的;也可能是由于肝炎时肝脏分泌胆汁不足或胆汁排泄不畅，胆汁成分发生改变，使胆道的运动能力下降，致患者的抵抗力降低，从而造成细菌感染。
5、血液系统并发症:包括溶血性贫血、血小板减少性紫癜、粒细胞缺乏症及再生障碍性贫血等各种血液并发症。其原因多数学者认为是自身免疫功能缺陷所造成的。当然，肝炎病毒感染直接损害骨髓造血系统或毒素损害骨髓造血系统及外周血细胞也可能是一个重要因素。
6、肝炎后血胆红素增高症:一些肝炎患者可能残留轻度黄疸，且持续不退，医学上叫做肝炎后血胆红素增高症。
7、肝炎后肝硬化:主要见于乙型、丙型肝炎患者，尤其是乙型、丙型混合重叠感染者，发生肝硬化的比例相对较高。
8、肝炎后肝癌:肝炎、肝硬化与肝癌的关系十分密切。多数学者认为，由肝炎而直接演变为肝癌的可能性较小，但在肝炎基咄上，受到其他因素的作用而转变成肝癌的可能性较大。
