（1）乙型肝炎：乙肝治愈首先得明确几个概念。评估乙肝疗效的指标包括生化学应答即血清ALT水平恢复正常；病毒学应答即血清HBV DNA水平下降或阴转；免疫学应答即HBeAg转阴伴或不伴抗HBe转阳；组织学应答即肝组织学的改善。如果以上几项均有应答，称之为完全应答；如果仅有1～3项应答，只能称为部分应答。
从以上的概念可以看出，慢性乙型肝炎要完全治愈是十分不易的。况且现在的抗乙肝病毒药物大多需要长期治疗，一旦停药可能会引起反弹。但鉴于慢性乙型肝炎的治疗目的是通过获得持续抑制HBV复制，从而缓解肝脏病变，以阻止失代偿肝硬化、肝衰竭和原发性肝癌的发生。所以，通过较长时间的治疗后，使慢性乙肝保持稳定，从而不发生能危及生命的失代偿肝硬化、肝衰竭和原发性肝癌的发生是完全有可能的，也是我们治疗乙肝能达到的较为现实的目标。
那么，肝炎患者何时才算好呢？简单地说，能达到完全应答，就算好，在稳定一段时间后，就可以停药。不能达到完全应答，不能算完全好。部分应答属于有效、好转或暂时稳定，但部分应答的患者一旦停药有可能引起病情的反复。从这点出发，临床上经常被问及的有关乙肝的疗程是多久的问题则无法回答，而取而代之是治疗终点的概念。即何时能达到治疗终点，何时就算好，也就能停药了。下面就分别阐述HBeAg阳性及HBeAg阴性患者的治疗终点。
1）对于HBeAg阳性患者：其治疗终点是肝功能正常，HBV DNA持续阴性，HBeAg血清转换。在以上指标中较难达到的是HBeAg血清转换（即俗称的大三阳变为小三阳），有的患者可能已出现HBeAg的阴转，但未见有抗HBe转阳。只有在证实HBeAg血清转换（间隔1～3个月连续2次查HBeAg转阴，抗HBe转阳）后至少6个月到一年可以停药，停药后的持续应答率可望达到70%～90%。停药后仍需要密切监测是否复发。
2）对于HBeAg阴性患者：其治疗终点尚未确定，即使PCR法HBV DNA持续阴性也可发生治疗后复发，所以需要长期治疗。最新版的美国肝病指南推荐针对HBeAg阴性慢性乙肝患者只有当患者清除HBsAg后，方可停药。
3）对于代偿性肝硬化患者：原则上应当长期治疗，但如果HBeAg阳性患者治疗达到HBeAg血清转换并巩固治疗至少6个月到一年后，或者HBeAg阴性患者治疗达到HBsAg清除，则可以停药。停药后必须密切监测是否复发和肝炎发作。
4）对于失代偿性肝硬化患者和肝移植后乙型肝炎复发患者推荐终生治疗。
（2）丙型肝炎：丙型肝炎患者的治愈与否相对比较明确。丙肝的治疗根据患者治疗前的丙肝基因分型，病毒载量的高低，及治疗初期快速病毒应答及早期病毒应答等情况，治疗的疗程较明确，一般24～48周。是否临床治愈也有明确的指标，即SVR（持续病毒应答）：指的是在停用干扰素加利巴韦林抗病毒治疗后6个月，血清的HCV RNA仍为阴性，肝功能正常。这是判断丙肝治愈的金标准，一般来说，达到SVR，丙肝就算治好了。当然，仍要注意休息，禁止饮酒，定期检查，防止复发。
