有些患者常以上腹出现肿块为首发症状，终末期出现腹水等肝功能不全的症状。
肝囊肿可以出现肝区疼痛、腹胀，有时囊肿突然增大或继发 感染，可以突然腹痛加剧或发烧。有时上腹部可 触及包块，有的患者出现腹痛、呕吐、黄疸。当囊肿过大时，可出现消化不良、恶心、呕吐和右 上腹不适或疼痛等症状。少数肝囊肿可出现囊肿 破裂、囊内出血、感染或短期内生长迅速、有恶变倾向等。
肝囊肿生长缓慢，所以可能长期或终生无症状，其临床表现也随囊肿位置、大小、数目以及 有无压迫邻近器官和有无并发症而异。
当囊肿长大到一定程度，可能会压迫胃肠道 而引起症状，如上腹不适饱胀，也有因囊肿继发 细菌感染而腹痛、发热的。挤压心脏时可以出现心衰，有的患者因为肝左叶囊肿而挤压到心脏。
