原发性肝癌常以腹部疼痛、腹胀、上腹部肿块、食欲下降、乏力、消瘦等而就诊，小肝癌往往是体检中发现。临床诊断标准如下：
1．AFP>400μg/L（微克/升），能排除活动性肝病、妊娠、生殖系胚胎源性肿瘤及转移性肝癌，并能触及坚硬有肿块的肝脏或影像学检查具有肝癌特征的占位性病变者。
2．AFP≤400μg/L（微克/升），有两种影像学检查具有肝癌特征性占位性病变，或有两种肝癌标志物（甲胎蛋白异质体、异常凝血酶原、γ-谷氨酰转肽同功酶Ⅱ及α-L-岩藻糖苷酶等）阳性及一种影像学检查具有肝癌特征性占位性病变者。
3．有肝癌的临床表现并有肯定的肝外转移灶（包括肉眼可见的血性腹水或在其中发现癌细胞），并能排除转移性肝癌者。
