化疗是一种传统的肝癌治疗方法，由于大多数肝癌不能手术切除，故化疗仍有一定效果。但肝癌是一种对抗癌药敏感性极低的癌症之一，可能与多药耐药基因（MDR）有关，所以化疗效果较差。为了克服化疗效果较差的问题，常常采用化疗药物经肝动脉插管灌注，疗效较好。常用的化疗药有顺铂（PDD）、阿霉素（ADM）、丝裂霉素（MCC）、5-氟脲嘧啶（5-Fu）、博莱霉素（BLM）等。临床上多种化疗药物联合应用可提高疗效，例如FAM方案（原发性肝癌常用化疗方案）中阿霉素、5-氟脲嘧啶、丝裂霉素的联合应用，BAF方案（FAM的改良方案）中阿霉素、5-氟脲嘧啶、博莱霉素的联合应用。
