1．乙肝病毒存在于肝细胞核内，而丙肝病毒一般在肝细胞浆内。
2．乙肝易发生母婴传播，婴儿易发生慢性化，成年人感染不易发生慢性化，而丙肝母婴传播之婴儿大多会清除病毒，成年人感染率较高，易发生慢性化。
3．与乙肝相比，丙肝的临床表现往往不明显，可无症状地发展20～30年，大多数患者是在偶然情况下被查出患有丙肝的。少数慢性丙肝患者可有轻重不一的乏力、右上腹不适症状。值得注意的是，症状的有无或其严重程度与肝脏病变的发展不成正比。
4．丙肝没有“健康携带者”的概念。有50％～75％的急性丙肝会演变为慢性，其中20％易发展为肝硬化和原发性肝癌。与乙肝相比，丙肝发展为肝癌、发生肝功能衰竭及消化道大出血、最终死于肝癌的比例都显著增高。
