脂肪肝也可为某种原发病的并发病。例如，糖尿病性脂肪肝是因为胰岛素绝对或相对不足，引起糖类和脂肪代谢紊乱，过多的脂肪储存于肝脏所致;高脂血症性脂肪肝与血脂增高转移于肝脏有关;肝炎后脂肪肝多与肝病恢复期食欲大增、盲目进补、过多地摄入营养物质、肝功能下降而影响脂质代谢，以及肝炎病毒本身(例如丙型肝炎病毒)可影响肝细胞脂肪代谢等有关。
而且，脂肪肝的恢复与否与原发病的恢复与否紧密相连。例如，肥胖性脂肪肝患者若体重不下降，其脂肪肝也是很难恢复的;糖尿病性脂肪肝若糖代谢不纠正，则用再多的降脂药物，对肝脏脂肪浸润也将无济于事，或者短期内肝脏脂肪量减少，但随后又将复发。
积极预防和治疗原发病，也是预防和治愈相关疾病所致脂肪肝的重要环节。糖尿病性脂肪肝应采取有效措施控制空腹及餐后血糖;肝炎后脂肪肝应积极杭病毒治疗及恢复肝功能;高脂血症性脂肪肝则应尽快降低血脂水平。
