由于乙肝病毒持久存在与复制，不易被人体免疫功能和治疗药物所清除，致使肝脏病变持续进展。所以，采用抗病毒为主的综合治疗。
（1）抗病毒治疗：主要用α干扰素和核苷类似物。干扰素在开始10～30d每日注射500万U，以后改为每周注射3次，每次500万U，24周为1个疗程。核苷类似物现在使用的有拉米夫定（0．1g，1天1次，至少使用1年），泛昔洛韦（0．25～
0．5g，1天3次，连用16周）、阿德福韦酯（10mg，1d1次，疗程12周）。
（2）免疫调整药物：①免疫增强剂，其中胸腺素α1（日达仙）可通过调节机体免疫功能间接抑制乙肝病毒复制。此外尚有白介素-2、免疫核糖核酸、特异性转移因子、香菇多糖、左旋咪唑等可促进机体细胞免疫功能恢复；②免疫抑制剂，如肾上腺皮质激素和甘草酸等，但应用激素要慎重。
（3）护肝及支持治疗药物：①护肝药，如肌苷、能量合剂等；②缓解炎症药，如激素、甘草酸、苦参碱、秋水仙碱等；③降酶药，如联苯双酯、五味子、垂盆草等；④退黄药，如熊去氧胆酸等。
（4）抗肝纤维化药物：如干扰素γ、秋水仙碱、鳖甲软肝片、大黄虫丸等。
（5）其他：肝细胞生长素、前列腺素E1、胰岛素-胰高糖素（G-I）可以促进肝细胞再生；乌鸡白凤丸可改善虚弱体质，促进蛋白合成，也可能有抗肝纤维化作用。
应强调的是在慢性乙肝较长的治疗期中，切忌滥用过多药物及应用伤肝药物，切勿乱投医或换药太频。
