慢性乙肝或慢性乙肝病毒携带者的治疗需要抓住两个关键环节：①有效抑制病毒以至于最终清除病毒。②打破免疫耐受，修复与重建病人自身的抗乙肝病毒特异性免疫应答。
两者是相互协同的。在抑制病毒复制，使病毒量下降时，抗乙肝病毒的特异性免疫能力会改善，有利于进一步重建抗病毒特异性免疫反应；而在打破了免疫耐受，重建正常抗病毒特异性免疫之后，一方面使抗病毒治疗措施（如用抗病毒药）效果提高；另一方面，通过病人自身的抗病毒特异性免疫应答，可以在相当长时间内抑制病毒，甚至于清除肝内的乙肝病毒DNA。因此，两种疗法联合治疗e抗原及乙肝病毒DNA均阳性的慢性乙肝及慢性乙肝病毒携带者，常常在一年疗程期满时，可有相当多病人乙肝病毒DNA与e抗原转阴，同时免疫耐受被打破，自身特异性病毒免疫得到重建和修复，取得包括乙肝病毒DNA和e抗原转阴的效果，e抗体由阴性变成阳性，特异性免疫学检查提示免疫耐受已被打破，出现了正常特异性抗病毒免疫应答。如果是慢性乙肝，治疗前血清转氨酶升高，则转氨酶恢复正常。达到这些指标后停止治疗，一般来说病情会稳定，复发率低。
