免疫耐受期是指机体免疫系统没有被激活，处于相对静止状态，与乙肝病毒“和平共处”。
特征：乙肝两对半大三阳或小三阳，尤以小三阳为多，HBV-DNA多为阳性，携带病毒超过半年以上，肝功能正常且稳定，B超提示肝脏无明显异常，无明显临床症状。
原因：造成肝功能异常，肝脏病理改变的主要原因是机体的免疫功能被乙肝病毒激活，免疫系统在杀灭乙肝病毒时伤及肝细胞的缘故。所以，当肝功能正常，肝脏无明显病理改变时，就间接说明，机体的免疫系统尚未被激活，处于相对静止状态，免疫反应极弱或无，无论使用什么药物，在得不到机体免疫系统配合的情况下，效果就会很差，所以作为抗病毒治疗就不是一个好的时期。
治疗指导：由于此期用药多半无效，因此建议患者不要急于治疗。注意定期检测肝功能，最好2～3个月检查一次，以寻找最佳治疗时机，当进入到免疫清除期后，则进行抗病毒治疗。现在临床上也有一种治疗方法，就是用免疫激活剂激活患者的免疫系统，使其由免疫耐受期进入免疫清除期。作者一般不赞成使用这种方法，因为免疫激活剂的力量有限，往往是部分激活，这样的后果是，既难以达到全面清楚乙肝病毒的作用，又会对肝细胞造成明显的损害。我常常接到患者的来信、来电，诉说原来肝功能一直正常，因为想转阴，治疗半年、一年后结果阴没转成，但肝功能却开始不正常了，就是这个原因。所以，免疫耐受期的患者最好是等待一段时期，让其自动进入免疫清除期再系统治疗为好。
