乙肝疫苗免疫接种后产生免疫效果的标志是产生保护性抗体（即抗-HBs阳性）。然而，接种了乙肝疫苗的人有时候也会有患乙肝的可能，这除了感染的乙肝病毒株可能发生变异外或婴儿宫内感染等情况外，还与少数人对乙肝疫苗的免疫反应有关。据报道，人群接种乙肝疫苗后，有5％～10％的人不产生保护性抗体或抗体水平很低，这些人称为无或弱免疫应答者。无或弱免疫应答的发生与许多因素有关，注射乙肝疫苗后能否预防乙肝，取决于疫苗能否刺激机体产生抗体以及抗体产生的多少。一般认为，血清抗体滴度>10U/L，才有可能预防乙肝，小于这个单位的称为弱免疫应答。注射乙肝疫苗后出现无或弱免疫应答与许多因素有关，主要的有：
（1）遗传因素：无、弱应答者与其一级亲属（父母、同胞兄弟姐妹）的应答强度有明显的相关性，这可能与遗传因素——人类白细胞抗原有关。
（2）免疫缺陷：某些无应答者的发生可能与HBsAg特异Tn细胞激活的缺陷有关。
（3）免疫耐受：有研究发现，在乙肝疫苗无应答者中免疫耐受可能是其主要原因。换句话说，潜在的HBV感染可能是乙型肝炎疫苗无应答的重要原因之一。曾有报道慢性无症状HBV感染者109例用Southern印迹杂交法检出肝内HBV-DNA阳性82例，其中仅35例（38％）用斑点杂交检出血清HBV-DNA阳性（中华内科杂志，1991，30：19）。由此可见，PCR未检出血清HBV-DNA的无应答者中也可能还是有HBV仅存在于肝内的潜在感染者。
