（1）肾移植患者的抗病毒治疗：慢性乙（或丙）肝伴以透析治疗维持的终末期肾病患者，在肾移植前是需要抗病毒治疗的。因为如果伴有活动性的乙（或丙）肝或失代偿期乙（或丙）肝肝硬化，可能会影响肾移植，或需要肝肾联合移植。非活动性乙（或丙）肝或乙（或丙）肝病毒的携带者，也会在肾移植后因需避免排异反应，而大量使用免疫抑制剂导致肝病的激活。所以，肾移植前的抗病毒治疗是有意义的。
慢性乙肝伴以透析治疗维持的终末期肾病患者，抗病毒治疗可选择核苷（酸）类似物。干扰素-α由于骨髓抑制作用及肝炎复发的危险不能应用于这类患者。迄今为止，临床报道应用较多的是拉米夫定，对于治疗需要在12个月以上并有拉米夫定高耐药危险的患者，可选择阿德福韦酯或恩替卡韦治疗。
HBV再激活可以发生在HBsAg阴性但抗HBc及抗HBs阳性和单一抗HBc阳性者中，但这不常见，对此类人群的常规预防方案，无更多的信息推荐。
2007年亚太肝病学会有关丙型肝炎诊断、处理和治疗的共识声明中明确指出：慢性丙肝患者伴以透析治疗维持的终末期肾病推荐普通干扰素单一治疗，长效干扰素因半衰期较长，不良反应较多，不适用于此类患者。利巴韦林因存在导致贫血的不良反应，针对大多数尿毒症同时已有贫血的肾病患者，则更不适用。所以，慢性丙肝患者伴以透析治疗维持的终末期肾病者除临床试验外不推荐聚乙二醇干扰素或利巴韦林治疗。肾移植后禁用干扰素治疗。
（2）接受免疫抑制药物或化学治疗的患者的抗病毒治疗：对这些患者，核苷（酸）类似物抗病毒治疗的另一重要作用即是预防HBV再激活。患者在接受治疗前，应对HBsAg进行筛选，对阳性者，则应在治疗前至治疗结束后至少12周的期间内予以口服抗病毒药物进行预防性治疗，并加巩固治疗即HBV再激活的预防治疗。部分单项抗HBc阳性的患者，也可考虑纳入HBV再激活预防治疗的范围，可以将治疗分为预防和巩固两个阶段。应当注意的是，HBV再激活的预防治疗不应考虑HBV DNA水平的高低，更不能等待转氨酶升高后再进行抗病毒治疗。
