大量的研究表明，乙肝患者体内存在着乙肝病毒自我清除机制，患者自身每日可清除外周血循环中大量乙肝病毒。乙肝病毒人体内动力学研究证明，乙肝病毒的半衰期为26．4小时，乙肝病毒存活期为36．6小时，日更新率为48％。这些数据说明机体对外周血循环中乙肝病毒有良好的清除能力。那么机体是靠什么来清除乙肝病毒呢？这主要依赖于体内的免疫功能。人体免疫功能包括体液免疫和细胞免疫两大部分，这两大系统的T细胞和B细胞可以直接或间接发挥杀灭乙肝病毒的作用。
机体免疫功能弱，就无法发挥杀灭乙肝病毒的作用，但如果过于强大，在杀灭乙肝病毒的同时，也会造成肝细胞的广泛性损伤，会出现肝脏的急性炎症反应，转氨酶升高，球蛋白、胆红素上升。
调节免疫功能还有一个重要的意义在于可以打破乙肝的免疫耐受状态，在乙肝治疗中起到关键性的作用。前面提到，乙型肝炎病毒的长期存在，以及抗病毒药物治疗效果不佳的原因，与宿主对乙肝病毒的免疫耐受有直接的关系。目前认为之所以产生免疫耐受，与机体在免疫系统尚未建立或完善之前，受到乙肝病毒的侵袭，或感染乙肝病毒后机体免疫机制遭到乙肝病毒的破坏，以致免疫系统对乙肝病毒不能识别，因而产生免疫耐受。由于抗病毒药物仅能杀伤血液、体液内的乙肝病毒，对在肝细胞内发生HBV-DNA整合的病毒无能为力，从而造成抗病毒药物作用有限，因此，医学界寄希望于人体免疫机制的重建，以打破机体对乙肝病毒的免疫耐受状态，这极有可能成为治愈慢性乙肝的一个重要突破口。
胸腺肽、多糖类（如灵芝多糖、香菇多糖、猪苓多糖）、左旋咪唑涂布剂、卡介苗等以及许多补益类、抗病毒类中药都属于免疫增强剂，可以提高免疫功能，有利于乙肝病毒的清除。研究还发现许多中药如黄芪、何首乌、巴戟天、白花蛇舌草、肉苁蓉、茯苓等均具有明显的免疫调节作用，能显著提高乙肝患者免疫抑制状态下的体液免疫和细胞免疫力，对特异性和非特异性免疫功能都有明显的增强作用。
环磷酰胺、激素等则属于免疫抑制剂，可以减轻机体免疫力对肝脏细胞的杀伤作用，在一定时候有利于肝脏炎症的恢复。
以上可见，免疫功能是一柄双刃剑，什么时候需要强，什么时候需要弱，取决于病人的具体情况和治疗的目的，由医师做出正确的决定。
