HBV-DNA是乙肝病毒基因，其有无、多少是乙肝病毒存在及有无复制能力的直接标志。在乙肝活动期，HBV-DNA一般均呈现阳性，病情越重，含量越高。目前临床对HBV-DNA有定性和定量两种检测方法。定性检测以阳性和阴性为报告标准，阳性说明体内有乙肝病毒感染，但不能说明病毒有多少。定性方法一般比较准确，很少出现误检，只要有少许病毒就能检测到，但由于不能定量，所以不能反映病毒的多少，现在较少使用。
HBV-DNA定量检测一般以copy/ml（拷贝/毫升）为单位，之前国内许多医院以HBV-DNA定量<105copy/ml（<102（EO2）或<103copy/ml）拷贝数是利用DNA信号扩增技术，推算出的乙肝病毒核酸含量，因此拷贝数是一个分子生物定量单位，不能代表具体的病毒数目。不过拷贝数越高，说明乙肝病毒核酸含量也越高，由此推测乙肝病毒的数量也越多。读者要注意的是，DNA复制程度的大小并不代表肝脏实际损害的程度，DNA复制程度高，并非就代表肝脏损害严重。反而有时，肝脏虽然损坏严重，由于免疫系统对病毒的清除，反而DNA会明显下降，这种情况要注意护肝，不要大意。总之，肝脏损伤的程度应该参考肝功能、B超或肝活检的结果。
由于HBV-DNA检测的技术条件要求较高，有的因条件、试剂不同，报告的结果不一，因此不同单位，不同设备条件下检测的结果可能缺乏可比性。所以，患者应该尽量固定在一、两家设备好、有信誉的医院检查，便于前后检查结果的对比。
HBV-DNA指标还是使用某些药物（如干扰素、拉米夫定等）和判断疗效的依据之一
