肝区疼痛、乏力、纳差、消瘦是最具特征性的临床症状。
肝区疼痛：最常见，间歇或持续性，钝痛或胀痛，由癌细胞迅速生长使肝包膜绷紧所致。侵犯膈肌，疼痛可放射至右肩或右背。向右后生长的可致右腰疼痛。突然发生剧烈腹痛和腹膜刺激提示癌结节包膜下出血或向腹腔破溃。
消化道症状：胃纳减退、消化不良、恶心、呕吐和腹泻等，因缺乏特异性而易被忽视。
乏力、消瘦、全身衰弱。晚期少数患者可呈恶病质状。
发热：一般为低热，偶达39℃以上，呈持续或午后低热或弛张型高热。发热与癌肿坏死产物吸收有关。癌肿压迫或侵犯胆管可并发胆道感染。
转移灶症状：肿瘤转移之处有相应症状，有时成为发现肝癌的初现症状。如转移至肺可引起咳嗽咯血，胸膜转移可引起胸痛和血性胸水。癌栓栓塞肺动脉或分支可引起肺梗死，可突然发生严重呼吸困难和胸痛。癌栓阻塞下腔静脉，可出现下肢严重水肿，甚至血压下降。转移至骨可引起局部疼痛，或病理性骨折。转移到脊柱或压迫脊髓神经可引起局部疼痛和截瘫等。颅内转移可出现相应的定位症状和体征，颅内高压亦可导致脑疝而突然死亡。
其他全身症状：癌肿本身代谢异常或癌组织的机体发生各种影响引起的内分泌或代谢方面的症候群称之为伴癌综合征，有时可先于肝癌本身的症状。常见的有：自发性低血糖症：10%～30%患者可出现，此症严重者可致昏迷、休克导致死亡，正确判断和及时对症处理可挽救患者避免死亡。
红细胞增多症：2%～10%患者可发生，可能系循环中红细胞生成素增加引起。
其他罕见的尚有高脂血症、高钙血症、类癌综合征、性早期和促性腺激素分泌综合征、皮肤卟啉症和异常纤维蛋白原血症等，可能与肝癌组织的异常蛋白合成、异位内分泌及卟啉代谢紊乱有关。
