肝脏本身的疾患，特别是各型病毒性肝炎、肝硬化、肝脓肿、肝结核、肝癌、脂肪肝、肝豆状核变性等，均可引起不同程度的转氨酶升高。
除肝脏外，体内其他脏器组织也都含有此酶，因此当患有心肌炎、肾盂肾炎、多发性肌炎、大叶性肺炎、肺结核、乙型脑炎、急性败血症、肠伤寒、流脑、胆囊炎、疟疾、钩端螺旋体并麻疹、流感、血吸虫并挤压综合征等时，均可见血中转氨酶升高。
因为转氨酶是从胆管排泄的，因此如果有胆管、胆囊及胰腺疾患，使胆管阻塞，转氨酶也可升高。
药源性或中毒性肝损害，以及药物过敏都可引起转氨酶升高，并常伴有胆汁淤积型黄疸和肝细胞损伤。
正常妊娠、妊娠中毒症、妊娠急性脂肪肝等也是转氨酶升高的常见原因。另外，剧烈运动后亦可引起转氨酶升高。
因此，不能单凭转氨酶升高或正常就诊断或排除肝炎，应结合症状、体征、流行病学资料及其他的化验结果进行全面分析而做出正确诊断。
