乙肝的抗病毒治疗时机应选在肝炎发作时期，转氨酶升高，乙肝病毒复制指标阳性，慢性乙肝处于中度～重度阶段。如果属于乙肝病毒携带者，处于免疫麻痹或耐受阶段，硬性使用抗病毒药物（如干扰素、核苷类似物等），收效甚微。
有些药物需要肌肉注射，有些药物需要静脉点滴，有些药物需要口服，给药途径不一，主要考虑到药物的吸收和代谢，以及毒副作用的耐受程度，如免疫调节剂左旋咪唑，口服毒副作用较大，多采用涂布剂形式外用。干扰素曾经使用过口含片剂，由于胃酸等胃内容物对药物的分解和破坏作用，使药物有效成分难以发挥，所以，干扰素只有肌肉注射给药才最为合适。
