许多患者认为只有“大小三阳全部转阴”才是乙肝治疗的唯一目的。其实，这种观点是非常不正确的，也不符合目前乙肝治疗的实际情况。比较客观科学的疗效判定标准可分为以下几种：
（1）临床治愈 血清学生化指标如转氨酶、胆红素等恢复正常，临床症状明显改善或消失，不论其病毒学标志如何，均可视为临床治愈。
（2）降低传染性 在临床治愈的基础上，经治疗血清HBV-DNA阴转或病毒复制呈明显下降，e抗原转阴而e抗体出现，即由“大三阳”转为“小三阳”，此类患者血中无完整的病毒颗粒，故传染性极低。肝脏损伤也相对较轻，对于招工、升学及妊娠应无明显影响，可进行正常的社会活动，但应坚持复查，观察病情变化。如出现下述情况之一，则应积极治疗：①血清HBV-DNA转为阳性；②肝功能异常，有明显临床症状；③e抗原阳转有明显肝脏纤维化倾向或早期肝硬化迹象。
（3）病毒清除 表现为血清中表面抗原阴转，血中及肝脏组织的HBV-DNA检查均为阴性，且追踪观察一年以上无复发。但乙肝病毒的彻底清除仍是尚待解决的问题，国前尚不能以此作为乙肝治愈的唯一标准。
如果用奥运会赛场的比赛来形容乙肝的治疗效果，那么HBV-DNA阴转为铜牌的获得，e抗原转阴而e抗体出现为银牌的获得，表面抗原的阴转才是金牌的获得。
