乙肝代偿期肝硬化的抗病毒治疗具体情况可分别做如下处理：
若血清HBV—DNA阴性，初期应每隔1个月检测1次血清HBV—DNA，连续2次；以后每3个月检测1次HBV—DNA，连续3次。若证实血清HBV—DNA持续阴性，则可不予抗病毒治疗。但以后仍须注意定期监测，一般每6个月检测1次血清HBV—DNA。同时注意监测肝功能、AFP及腹部B超等的变化。
若PCR法多次（间隔1月以上）检测到血清HBV—DNA，则不论HBV—DNA水平高低，也不论ALT水平和HBeAg是否阳性，均考虑给予抗病毒治疗。偶尔1次检测到HBV—DNA阳性不宜作为立即开始抗病毒治疗的依据，而应注意复查。
原则上宜优先选用核苷类药物进行抗病毒治疗，普通IFNα及PEG—IFNα两种干扰素类药物一般作为次一级的治疗选择。宜优先选用ETV或TDF进行长期抗病毒治疗。
而乙肝失代偿期肝硬化抗病毒治疗应做以下处理：
现在多主张，只要明确是乙肝失代偿期肝硬化，即使血清HBV—DNA阴性，也予抗病毒治疗。但不得选用干扰素进行治疗。应优先选用抗病毒能力强、耐药率低的药物进行抗病毒治疗。失代偿期患者应终生接受核苷类药物抗病毒治疗，并接受更为密切的血清学、生化学、AFP和影像学监测等。
