在诊治肝病时，脏腑辨证运用较多。如肝病初期，病位多在脾胃，累及肝胆，病机多为湿热阻滞脾胃，壅塞肝胆，治疗上以清热利湿，疏肝和胃醒脾为主，常用的药物有藿香、佩兰、砂仁、杏仁、绿萼梅、玫瑰花、杏仁、橘红、茯苓、木瓜、佛手等。肝病迁延之中后期，则可出现肝肾阴虚、脾肾阳虚，应辨何脏有余不足，随证补泻。如多用白芍、当归、丹参、生地等以养肝柔肝；熟地、山药、女贞子、黄精、五味子等滋补肾阴；淫羊藿、仙茅、肉苁蓉、补骨脂、鹿角胶等温补肾阳，并可适当配伍肉桂、附子、葫芦巴等以振奋肾阳，改善脏腑功能。
在脏腑辨证中强调治病求本，注重后天之本，应遵循“调理肝、脾、肾，中州要当先”的治则，调理脾胃，此乃“有胃气有生也”。在慢性病毒性肝炎的治疗中，则要“扶正祛邪，调理气血”。慢肝开始是由于湿热之邪缠绵羁留损伤正气，造成“因病而虚”，逐步形成脏腑气血功能失调和机体防御能力减弱，以致正不抗邪，招致湿热内侵，造成“因虚而病”，以正气虚为矛盾的主要方面，治疗中注意调理中州，稍佐祛邪，使湿热余邪无处藏身，更无由以生。若湿从寒化，以致脾肾阳虚，中气不运，当以健脾助阳，温化寒湿，仍以调理中州为要。
