肝癌的治疗早期可以手术切除，早期切除是提高生存率的关键，肿瘤越小，五年生存率越高。一部分病人可以长期存活，但是术后复发的比例很高，提倡定期复查和长期中药、免疫治疗以降低复发、转移的危险。
中晚期病人手术无法切除而一般情况尚允许的时候，可以选择多种局部疗法综合治疗，如肝动脉化疗栓塞（俗称介入治疗，是20世纪80年代发展的一种非手术的肿瘤治疗方法，对肝癌有很好疗效，甚至被推荐为非手术疗法中的首选方案）、放射治疗（由于放射源、放射设备和技术的进步，各种影像学检查的准确定位使放射治疗在肝癌治疗中地位有所提高，疗效亦有所改善。放射治疗适于肿瘤仍局限的不能切除肝癌，通常如能耐受较大剂量，其疗效也较好）、化疗（对肝癌较为有效的药物有阿霉素及其衍生物、丝裂霉素、氨甲喋呤等）。
其他如超声刀聚焦（俗称海扶刀）、瘤内酒精或药物注射、射频治疗，并结合中医药、免疫治疗等等，部分病人也可取得不错的疗效。有些早期病人如果因年龄大或合并其他身体疾病不能承受手术的，也可以尝试局部治疗和中医药、免疫疗法相结合的方案。
