正如前面所讲，
甲肝是甲型肝炎病毒主要经粪口途径即消化道感染所得。带有
甲肝病毒的粪便污染饮用水源、食物、蔬菜、玩具等可引起流行。甲肝病毒感染人体后，在感染者的肝细胞内复制，从而造成肝细胞的损伤，引起肝脏炎症。在甲肝的潜伏期（最短15天，最长45天，平均约为30天，尤其是黄疸前25天）和黄疸前期是排毒的高峰期，无症状的亚临床感染者粪便中也含有大量病毒。因此，处在这个时期的甲肝患者或无症状感染者都是很危险的传染源。如果对粪便的处理不善，消毒不严，污染了食物或水源，在未消毒的情况下被其他人食用或饮用后，甲肝病毒就会随之进入其消化道，并侵犯肝脏而发生感染。另外，如果甲肝病毒感染者大便后未洗手，则手上可能带有病毒，用污染了甲肝病毒的手处理食物也会造成食物污染，从而导致甲肝病毒的传播。所以，很多机构发生甲肝流行时，其感染源往往与食堂的工作人员有关。输血后感染甲肝病毒极罕见，一般说来，只有在病毒血症期的甲肝病毒感染者在不自知的情况下输血，而受血者又缺乏对甲肝病毒的
免疫力时而感染。
