在治疗过程中肝癌的预防主要从以下三个方面进行：
术前：术前能明确诊断者不必要行穿刺细胞学检查；术前行肝动脉造影检查有利于发现微小病灶；对不能切除肝癌术前行肝动脉插管栓塞或化疗，肿瘤缩小后再切除；对能切除肿瘤术前不进行介入治疗。
术中：术中避免不必要的探查及挤压肿瘤；有条件时在切除前先予肿瘤边缘射频、微波固化或冷冻等治疗，有望减少术中肿瘤播散可能；术中B超检查有利于发现肝内多发病灶及微小病灶；如合并脾亢且条件允许时尽可能切除脾脏，纠正脾亢，有利于术后化疗；术中经肝动脉或门静脉放置化疗泵有利于术后化疗；关腹前用蒸馏水及5-氟尿嘧啶冲洗腹腔以杀灭腹腔游离的癌细胞。
术后：术后按疗程坚持化疗，必要时进行介入治疗，配合提高免疫力药物、中医中药等综合治疗，以提高疗效。
