一般来说，急性乙肝患者经过适当休息和治疗，乙肝病毒表面抗原及其他指标都能转为阴性。适当的治疗包括使用保肝抗炎药物，如葡萄糖、能量合剂、维生素C、中药茵栀黄、金银花制剂等。一般不必使用特殊的抗病毒药物，如拉米夫定、干扰素等。如果急性乙肝患者滥用药物，虽能使表面抗原强行转阴，但并未彻底消灭肝炎病毒，同时由于某些药物打乱了身体免疫功能，反而使肝病向慢性活动性肝炎发展。
慢性乙肝患者乙肝病毒表面抗原转阴相当困难，慢性乙肝患者乙肝表面抗原可持续携带多年、数十年，部分甚至终生携带。根据多年随访观察调查，乙肝患者乙肝病毒表面抗原自然阴转率为2％～5％。乙肝病毒携带者乙肝表面抗原阴转与否，与携带者本身机体免疫状况、表面抗原滴度的高低及e抗原阳性与否有关。
