临床上有不少“大三阳”者无症状、肝功能正常，一般称为慢性“乙肝表面抗原携带者”（但事实上，其中有相当一部分人病理上有轻重不等的肝脏损害），而对那些有症状和肝功能异常者，称之为慢性乙肝病人。那么，有了“大三阳”该怎么办呢？原则上说，“大三阳”者应进行保肝、抗病毒和抗肝纤维化治疗。保肝和抗肝纤维化治疗适合于所有“大三阳”病人，但所有“大三阳”病人是不是都要进行抗病毒治疗呢？答案是否定的。只有那些转氨酶高（高于2倍正常值）的病人才有可能取得良好的疗效。因此，对那些肝功能正常或基本正常的“大三阳”，特别是通过垂直传播获得感染者，并不主张进行抗病毒治疗。
普通干扰素的乙肝e抗原的血清转换率（俗称“大三阳”转为“小三阳”）不到40％。好在现在又上市了一种新的干扰素——聚乙二醇干扰素（α-2a），疗效优于普通干扰素，使用起来较普通干扰素方便，只要一周一次。抗病毒治疗的疗程一般最短要半年，可以根据治疗的结果在专业医生的指导下决定治疗方案和疗程。
不是所有转氨酶高的病人都能取得满意的抗病毒效果。这一方面是目前所有药物本身的抗病毒疗效不是令人很满意，另一方面，临床上引起转氨酶高的非肝炎因素很多，如劳累、休息不好、酒精、药物等，有其他肝胆疾病如脂肪肝、胆囊炎、胆石症等，其他系统的疾病如心血管疾病、肾脏疾病等，这些因素容易被误认为肝炎活动所引起，而导致抗病毒疗效差。因此，在抗病毒治疗前一定要注意鉴别。
