对乙肝患儿的治疗应注意卧床休息。饮食要考虑各种营养成分搭配，食物应容易消化，每餐不宜摄入过多，注意防止脂肪肝。
目前国际公认，在治疗慢性肝炎的抗病毒药物中，α干扰素疗效是比较确切的。干扰素作为一种广谱抗病毒制剂，不能直接杀伤病毒，主要通过与细胞表面干扰素受体结合使细胞产生抗病毒蛋白，从而抑制病毒复制。此外干扰素有免疫调节作用，可增强机体抗病毒能力。对乙肝患儿应用干扰素α-1b治疗后，通过测定血清及肝内乙肝抗原或乙肝病毒复制指标，发现血清乙肝病毒DNA或乙肝核心抗原缓慢下降，同时肝内DNA形成及乙肝e抗原减少，血内乙肝表面抗原下降很慢。在停用干扰素治疗后，病毒清除较持久，并可出现乙肝核心抗体，病毒终止复制伴肝功能改善。对于肝功能正常的乙肝病毒携带者来说，感染多在婴幼儿时期，治疗效果较差。
抗病毒药物的选择：①首选α-干扰素，剂量为<5岁100万U，5～10岁200万U，>10岁300万U，每周3次，疗程10～12个月，母婴传播者及乙肝相关肾炎者可延长疗程或间歇重复治疗；②拉米夫定每天每千克体重3mg，需服药1年以上；③免疫调节剂胸腺素α1（即日达仙）每平方米体表面积1．6mg皮下注射，连续注射4d，以后每周2次。
应强调的是，抗病毒治疗时亦应加强综合治疗，注意打破免疫耐受性。儿童乙肝绝大多数缺乏典型症状，应定期检查肝功能，不要乱治疗。乙肝相关肾炎可能还需联合治疗。应用药物治疗一定要在医生指导下进行。
