HBV-DNA定量的方法包括酶标法和荧光法。
（1）酶标法。先用PCR法将HBV-DNA进行扩增，然后将扩增产物在酶标板探针作用下显色，最后与标准曲线对比计算出定量结果。
（2）荧光法。将荧光探针加入标本一起进行扩增，动态观察荧光的变化并与标准荧光变化进行比较，根据标准荧光梯度曲线计算出所测标本HBV-DNA的含量。荧光法比酶标法更加精确，应用也更广。HBV-DNA定量检测虽然可重复性及灵敏度稍低于PCR定性方法，但是HBV-DNA定量检测可以作为判断有无乙肝病毒感染的依据，并可作为预后判断的重要指标。
