e抗原(HBeAg)和e抗体(HBeAb)
e抗原是病毒的分泌型核壳蛋白。HBeAg和HBeAb是观察病情和疗效的最重要的指标：HBeAg阳性时，病毒复制活跃，传染性强大，通常病情属于活动期；当免疫系统被激发，病毒复制减弱并逐渐被清除，HBeAg转阴，并产生HBeAb(即HBeAg-／HBeAb+称为血清转换)，此时大多病毒复制停止，病变活动静息，因此出现，血清转换是判断病情趋向和药物疗效的一个重要指标。
核心抗体(HBcAb)
核心抗原是病毒的结构型核壳蛋白，在血液中一般检测不出，具抗原性很强，可诱发机体产生核心抗体HBcAb。该抗体含量高代表病毒感染并常伴有肝脏炎症，而HBcAb的降低代表病情趋向好转，低含量HBcAb表示过去感染。
