从医学的角度来说，对于慢性乙肝的最理想治疗目标当然是上述血液中的病毒指标全部转阴。但是，到目前为止，国际和国内医学界尚没有能够达到这一目标的有效方法。目前许多国家有关慢性乙肝的诊疗指南中都把治疗目标定为：持续抑制病毒复制，减轻肝脏炎症坏死从而延缓和阻断肝硬化和肝癌的发生。这就提示我们，把转氨酶恢复正常作为惟一的治疗目标是切合实际的，而一味追求所谓“转阴”则显得“好高骛远”。因为乙肝病毒感染并恢复以后，相当一部分人会产生抗体，持续几十年。所以如果只是抗体阳性，乙肝病毒的抗原和乙肝病毒DNA都是阴性，只能说明是既往感染，目前体内没有病毒。如果了解了这一点，有些别有用心的“虚假广告”如宣称“全部转阴”就不攻自破了。
慢性乙肝是一个感染性疾病，病原体是乙肝病毒。既然有病毒，那么通过抗病毒治疗达到消除体内存在的病毒是最理想的结果。也就是说，抗病毒治疗属于“治本”。但是，一方面目前所有抗病毒药物都不可能达到100％的疗效，长期疗效最高也不过40％左右；另一方面，不是所有患者都能够承受抗病毒药物的高额费用。而患者有症状时就需要治疗，这时医生会开出各种各样的“保肝”药物，以缓解诸如乏力、胃口不好、低热、失眠甚至黄疸等症状。这些都属于对症治疗，是“治标”，对“转阴”不会产生任何影响。
