庚肝病毒感染后临床上可能有以下几种转归：
一过性的病毒血症，病毒很快被人体清除，称隐性感染。
病毒持续存在，部分患者始终处于低滴度状态，少部分血清里含有中到高滴度的HGV，但均无临床症状，为无症状病毒携带者。
出现急性肝炎表现。单纯庚肝病毒感染的ALT增高程度及黄疸深度可能比急性丙型肝炎轻，但临床上常与丙型肝炎，甚至乙型肝炎合并感染，多数患者很快康复。病情延迟，转氨酶随血中病毒滴度的波动而出现间隙性增高。
少数病情迁延，反复发作成为慢性肝炎。
可能引起暴发型肝炎。有资料表明，以亚急性重型肝炎多见。
可发生肝硬化和肝癌。庚型肝炎慢性感染到发生肝硬化需较长时间，但一旦发生肝硬化，病情急转直下，进展极快；庚型肝炎是肝细胞癌的相关因素，但大多数情况下，肝癌的发生可能是乙肝或丙肝病毒与庚肝病毒的协同作用。
