病毒性肝炎往往都有后遗症，其主要表现在两方面：
（1）肝炎后高胆红素血症。出现该症状的主要特点是肝炎已达临床治愈标准，虽然活动量增加也没有反复，转氨酶也正常，但巩膜仍残留黄疸，血清胆红素未恢复正常，一般在17．1～34．2毫摩尔／升，极少数超过85．5毫摩尔／升，且以间接胆红素为主，以残留的胆红素常在劳累或感冒后有小幅度波动，当休息或感冒痊愈后迅速下降。出现该症状的主要原因是肝脏胆红素代谢障碍，可能与葡萄糖醛酸转换酶发生缺陷有关。
对于肝炎后高胆红素血症的治疗尚无速效方法，一般成人用苯比妥30～60毫克，1日4次，但停药后黄疸可能会反弹。肝炎后高胆红素血症如长期观察确无肝炎活动现象，可在密切观察下逐渐增加活动。肝炎痊愈后，残留轻度的胆红素并不影响正常的工作和生活。
（2）肝硬化。少数肝炎患者可发展为各种不同类型的肝硬化，如坏死后肝硬化、门脉性肝硬化和胆汁郁积性肝硬化。
预防可从以下几方面进行：①对丙型肝炎，只要诊断确立，不管急性还是慢性符合适应证者，应尽早给予抗病毒治疗，急性丙肝抗病毒有效率可达80％～90％，效果比乙肝好，有研究表明利用干扰素治疗丙肝，肝硬化进程可延迟7年以上。
②对乙型肝炎：对乙型肝炎病毒DNA（＋）和／或HBeAg（＋）、肝功能异常者主张抗病毒治疗，干扰素治疗可使35％～45％的HBeAg和乙型肝炎病毒DNA阴转，但其远期疗效有待继续观察。
③防止肝细胞坏死，促进肝细胞修复，改善肝功能：促进肝硬化的形成是由于肝细胞持续不断的炎症和坏死造成的，对肝损害明显者，建议住院／积极治疗为好。
④肝炎活动期宜卧床休息，病情好转后宜逐渐增加活动量，做到劳逸结合。
⑤饮食宜用高蛋白（肝性脑病者除外）、高纤维素、高维生素、易消化的食物，多吃蔬菜，适量食用碳水化合物和脂肪类食物，必须忌酒。
⑥避免使用对肝脏有损害的药物，必须用药的应在医生指导下进行。
⑦定期复查：慢性乙型、慢性丙型肝炎患者都应定期到医院复查，无论肝功能是否正常，都应该定期做B超动态观察，作系列血清化验，以便了解病变的进程，随时调整治疗。
